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Nos encontramos en el período Devónico de la Era Primaria, hace 380 millones de años, en el noroeste de lo que hoy es Gipuzkoa. El mar cubría entonces esta zona, era un mar cálido y poco profundo. Era un mar interior de un gran supercontinente, llamado Pangea, del que derivan los actuales continentes por una fractura y lenta deriva que nunca se ha detenido. En ese mar comenzaron a depositarse los sedimentos que hoy forman las pizarras metamórficas del llamado Macizo de Cinco Villas. Un área que a fines del Carbonífero, hace 280 millones de años, comenzó a emerger del mar. Se produjo una elevación y pliegue de los fondos marinos, debido a la orogenia hercínica que formó las primeras tierras emergidas del País Vasco. El Océano Atlántico aún no se había formado y el País Vasco estaba próximo al actual Canadá, Islas Británicas y Bretaña Francesa.

Montes de Errenteria
Durante la Era Secundaria o Mesozoico, que se inicia hace 220 millones de años, tiene lugar una fuerte erosión de los materiales paleozoicos de la Era Primaria. El clima era árido y con fuertes lluvias torrenciales. Surgen así ríos que arrastran y redondean esos materiales formando cantos rodados que se sedimentan en la costa durante el Triásico, hace 200 millones de años. Estos cantos se rodearon de un cemento silíceo y originaron conglomerados. Conforme la erosión iba allanando el relieve los ríos fueron perdiendo capacidad de arrastre y depositaron cantos de menor tamaño, luego arenas y finalmente arcillas.
Durante el Triásico y con la llegada del período Jurásico, hace 180 millones de años, se produce un hundimiento de la masa continental, de modo que el mar vuelve a cubrirnos, el actual Océano Atlántico comenzaba a formarse. Durante este período se depositan sedimentos calizos y margosos, en una época de clima cálido y escasos movimientos tectónicos.
En el Cretácico, hace 130 millones de años, el fondo marino comienza a recibir aportes arcillosos y arenosos procedentes de un margen continental situado al sur. Continúan depositándose calizas y margas, pero también conglomerados, areniscas y limos. Estos depósitos, en el Cretácico superior, hace 70 millones de años, forman una alternancia de estratos de margas, calizas y areniscas que constituyen el denominado Flysch.
En este mar que cubrió la región a lo largo del mesozoico vivieron multitud de organismos; braquiópodos como las Rhynchonelas y Terebratulas, moluscos como los Pecten, Ammonites y Belemnites, equinodermos crinoideos y equínidos como Cidaris y Micraster, peces como Lepidotes y Selaceos, etc.
Hace 60 millones de años comienza la Era Terciarla o Cenozoica con un brusco cambio en las formas de vida. Muchos de los organismos marinos del Mesozoico son sustituidos por otros (no sólo se extinguieron los famosos dinosaurios). Entre los dos períodos comienzan a depositarse calizas y calizas margosas en el fondo marino y, más tarde, areniscas que se incorporan al Flysch. Un fondo marino que hace 40 millones de años empieza a sufrir los efectos de la colisión y soldadura de las placas ibérica y europea. Se está produciendo una nueva orogenia, la orogenia Alpina. Estos fondos, con todos los depósitos anteriores que hemos ido señalando se pliegan y fracturan y al elevarse sobre el mar, comienzan a originar los montes del noroeste de Gipuzkoa.
El mar se retira más lejos que la costa actual y comienzan esos depósitos a erosionarse. Surgen ríos que forman valles sobre los materiales más blandos o que aprovechan las zonas de fractura para trazar su cauce -como el río Oiartzun- y el mar erosiona la costa que comienza a retroceder. Hace unos 3 millones de años, a fines del Terciarlo, y tras más de 35 millones de años de erosión, queda ya casi definido el relieve actual.
Si desde el Añarbe nos dirigimos a la costa iremos encontrando a nuestro paso todos los depósitos y rocas que hemos ido señalando. Primero encontraremos materiales del Paleozoico en Añarbe, Malbazar, Aldura y Zaria. En las zonas altas de Igoin y Urdaburu encontramos las areniscas y conglomerados del Triásico. En Landarbaso afloran materiales del Jurásico, junto con calizas del Cretácico. A partir de Listorreta y hasta Errenteria encontramos materiales más blandos de finales del Cretácico. A nuestra izquierda, en Txoritokieta y San Marcos (sobre un diapiro) tenemos materiales más duros del Jurásico y Cretácico. Y en la zona norte de San Marcos y en Capuchinos tenemos rocas del paso del Secundario al Terciario. Antes de alcanzar la costa nos encontramos con el monte Jaizkibel compuesto de areniscas de inicios del terciario.